Výzkumné pracoviště Oddělení Biotechnologie
- Název
- Oddělení Biotechnologie
- Název anglicky
- Department of Plant Biotechnology
- Zaměření výzkumného pracoviště
- Využití biotechnologických metod pro šlechtění rostlin - kultivace rostlin in vitro, prašníkové kultury, genetické transformace a molekulární detekce GMO. Molekulární markerování znaků, odlišování odrůd pomocí DNA markerů. Detekce rostlinných patogenů pomocí molekulárních a imunochemických metod. Biochemická analýza rostlinného materiálu a půdních vzorků. Využití metod obrazové analýzy.
- Zaměření výzkumného pracoviště anglicky
- Use of biotechnological methods for plant breeding - in vitro plant cultivation, anther cultures, genetic transformations and molecular detection of GMOs. Molecular marking of traits, differentiation of varieties using DNA markers. Detection of plant pathogens using molecular and immunochemical methods. Biochemical analysis of plant material and soil samples. Use of image analysis methods.
- Výzkumná organizace
- Agritec Plant Research s.r.o.
- Celá adresa
- Zemědělská 2520/16, Šumperk, Šumperk, Olomoucký kraj, Česko, 787 01
Kontaktní osoba
- Jméno
- Jiří
- Příjmení
- Horáček
- horacek@agritec.cz
- Telefonní číslo
- +420 732 560 008
Výzkumné programy pracoviště
| Název výzkumného programu | Název výzkumného programu v angličtině | Zaměření výzkumného programu | Zaměření výzkumného programu v angličtině |
|---|---|---|---|
| Kompoziční analýza rostlinného materiálu | Composition analysis of plant material | Využití analytických metod pro zemědělskou praxi. Analýza rostlinného materiálu a půdních vzorků. Stanovení dusíkatých látek, škrobu, tuku, mastných kyselin, antinutričních látek a mikroprvků v semenech zemědělských plodin. Analýza půdních vzorků. | Use of analytical methods for agricultural practice. Analysis of plant material and soil samples. Determination of nitrogenous substances, starch, fat, fatty acids, antinutritive substances and microelements in seeds of agricultural crops. Analysis of soil samples. |
| Využití biochemických a molekulárních metod pro diagnostiku virových a houbových patogenů rostlin | Use of biochemical and molecular methods for the diagnosis of viral and fungal pathogens of plants | Využití možností biochemické, molekulární a imunochemické diagnostiky pro pěstování, šlechtění a ozdravování zemědělských plodin. Detekce rostlinných virů metodou ELISA, detekce houbových chorob metodou ELISA a PCR, identifikace patogenů metodou PCR. Šlechtění s využitím molekulárních markerů odolnosti vůči vybraným patogenům. | Utilization of possibilities of biochemical, molecular and immunochemical diagnostics for cultivation, breeding and healing of agricultural crops. Detection of plant viruses by ELISA, detection of fungal diseases by ELISA and PCR, identification of pathogens by PCR. Breeding using molecular markers of resistance to selected pathogens. |
| Vývoj a aplikace biotechnologických metod ve šlechtění rostlin | Development and application of biotechnological methods for plant breeding | Vývoj biotechnologických metod a metod genového inženýrství (klasická genetická transformace; NBT – nové šlechtitelské techniky) pro přímé využití ve šlechtitelských programech zemědělských plodin, zejména luskovin (hrách, bob, lupina) a průmyslových plodin (len, konopí, řepka). Tvorba dihaploidů pro zkrácení šlechtitelského procesu, vývoj a optimalizace technik regenerace a mikropropagace, využití planých forem pro mezidruhovou hybridizaci, testování in vitro, agrobakteriální transformace. Zaměření – změny složení obsahových látek semen, zvýšení rezistence vůči rostlinným patogenům, suchovzdornost, fytoremediace toxických těžkých kovů. | Development of biotechnological methods and methods of genetic engineering (classical genetic transformation; NBT – New Breeding Techniques) for direct application in the breeding programmes of agricultural crops, namely grain legumes (pea, fababean, lupin) and industrial crops (flax/linseed, hemp, winter rape). Doubled-haploid production for shortening of breeding process, development and optimization of regeneration and micropropagation techniques, utilization of wild forms for interspecific hybridization, in vitro testing, agrobacterial transformation. Objectives–the changes of seed substances composition, improvement of resistance to plant pathogens, drought tolerance, phytoremediation. |
Přístroje pracoviště
| Název přístroje | Technické označení přístroje | Konkrétní využití | Způsoby a možnosti využití podniky (v průmyslu) | Podmínky využití přístroje třetí stranou | Rok výroby | Životnost (počet let) | Přenositelný přístroj |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Analyzátor FT-NIRS | FT-NIRS Nicolet Antaris II | Analýza semen luskovin, olejnin, obilovin | 2021 | Ne | |||
| Atomový absorpční spektrometr duální | Thermo Solaar 5 | Stanovení mikroprvků v rostlinném materiálu a v půdě, možnost měření v plameni i v kyvetě | Ne | ||||
| Automatický analyzátor tuků | Gerhardt Soxtherm | Stanovení tuků dle Soxhleta - analýza olejnatých semen | Ne | ||||
| Digitální obrazová analýza | analýza obrazu - software NIS Elements | detekce poškození listů, určení tvaru a barvy listů, květů, kořenů, fenotypizace | Ne | ||||
| ELISA reader | Molecular Devices Versa max | Detekce rostlinných virů a mykotoxinů | Ne | ||||
| Fytokomory | jarovizace, pěstování rostlin za přesně určených podmínek | Ne | |||||
| Hlubokomrazicí box -70oC | Sanyo | Dlouhodobé uchování vzorků při -70stC | Ne | ||||
| Laminární boxy typu Biohazard | Steril - Bioban | sterilní práce s tkáňovými kulturami | Ne | ||||
| Mikrovlnný rozkladný systém pro AAS | Milestone Ethos D | Příprava vzorků pro AAS - rozklad rostlinných a půdních vzorků | Ne | ||||
| PCR termocykler | BioRad | molekulární detekce metodou PCR | Ne | ||||
| Plynový chromatograf | DANI - GC 1000 | Analýza olejů - stanovení mastných kyselin | Ne | ||||
| Průtokový cytometr | Partec PA II | Určení ploidie | Ne | ||||
| qPCR temocykler | BioRad | molekulární detekce metodou kvantitativní real-time PCR | Ne | ||||
| Zařízení pro Kjeldahlizaci | VELP | Stanovení N-látek dle Kjeldahla | Ne |
Výzkumné programy pracoviště (podrobné)
Výzkumný program: Kompoziční analýza rostlinného materiálu
- Název výzkumného programu
- Kompoziční analýza rostlinného materiálu
- Název výzkumného programu v angličtině
- Kompoziční analýza rostlinného materiálu
- Zaměření výzkumného programu
- Využití analytických metod pro zemědělskou praxi. Analýza rostlinného materiálu a půdních vzorků. Stanovení dusíkatých látek, škrobu, tuku, mastných kyselin, antinutričních látek a mikroprvků v semenech zemědělských plodin. Analýza půdních vzorků.
- Zaměření výzkumného programu v angličtině
- Use of analytical methods for agricultural practice. Analysis of plant material and soil samples. Determination of nitrogenous substances, starch, fat, fatty acids, antinutritive substances and microelements in seeds of agricultural crops. Analysis of soil samples.
- Popis vybraných dosavadních výsledků výzkumného programu
- HORÁČEK J. (2008): Optimalizovaná metodika pro stanovení inhibitorů trypsinu u hrachu (Pisum sativum L.), Uplatněná metodika, schváleno 2.12.2008, ISBN 978-80-903868-3-9 DOSTÁLOVÁ R., HORÁČEK J.: Sledování změn obsahu škrobu a rezistentního škrobu u hrachu. Chem. Listy 103, 2009, p. 753-782 POSLUŠNÁ J., HORÁČEK J., ONDRÁČKOVÁ E., VACULÍK A., VĚTROVCOVÁ M., HAVEL J., PLACHKÁ E., BÁRNET M., CIHLÁŘ P., KOLAŘÍKOVÁ K.: Vliv lokality na obsah kadmia v makových semenech (Papaver somniferum L.), Úroda 12, vědecká příloha časopisu, 349-352, 2018
- Reference VaV činnosti (výběr)
- Reference řešených výzkumně – vývojových projektů (výběr)
- Webové stránky výzkumu
- Klíčová slova
-
chemická analýzaanalýza půdních vzorkůkompoziční analýzalaboratorní služby
Kategorie
| Hlavní obor | Vedlejší obor | Vedlejší FORD | RIV kategorie |
|---|---|---|---|
|
Agricultural and veterinary sciences |
Agricultural biotechnology |
Přístroje výzkumu
| Název přístroje | Technické označení přístroje | Konkrétní využití | Způsoby a možnosti využití podniky (v průmyslu) | Podmínky využití přístroje třetí stranou | Rok výroby | Životnost (počet let) | Přenositelný přístroj |
|---|
Nebyly nalezeny žádné odpovídající přístroje
Možnosti spolupráce
| Možnost spolupráce | Možný rozsah spolupráce | Garantující výzkumný pracovník | Možnosti kontaktování |
|---|---|---|---|
| Využití služeb chemické laboratoře pro analýzu rostlinného materiálu a půdních vzorků | Dle kapacity laboratoře | Mgr. Jiří Horáček, Ph.D. | horacek@agritec.cz |
Výzkumný program: Využití biochemických a molekulárních metod pro diagnostiku virových a houbových patogenů rostlin
- Název výzkumného programu
- Využití biochemických a molekulárních metod pro diagnostiku virových a houbových patogenů rostlin
- Název výzkumného programu v angličtině
- Využití biochemických a molekulárních metod pro diagnostiku virových a houbových patogenů rostlin
- Zaměření výzkumného programu
- Využití možností biochemické, molekulární a imunochemické diagnostiky pro pěstování, šlechtění a ozdravování zemědělských plodin. Detekce rostlinných virů metodou ELISA, detekce houbových chorob metodou ELISA a PCR, identifikace patogenů metodou PCR. Šlechtění s využitím molekulárních markerů odolnosti vůči vybraným patogenům.
- Zaměření výzkumného programu v angličtině
- Utilization of possibilities of biochemical, molecular and immunochemical diagnostics for cultivation, breeding and healing of agricultural crops. Detection of plant viruses by ELISA, detection of fungal diseases by ELISA and PCR, identification of pathogens by PCR. Breeding using molecular markers of resistance to selected pathogens.
- Popis vybraných dosavadních výsledků výzkumného programu
- Reference VaV činnosti (výběr)
- Reference řešených výzkumně – vývojových projektů (výběr)
- Webové stránky výzkumu
- Klíčová slova
-
elisapcrmolekulární markerydetekce rostlinných virůdetekce fytopatogenů
Kategorie
| Hlavní obor | Vedlejší obor | Vedlejší FORD | RIV kategorie |
|---|---|---|---|
|
Agricultural and veterinary sciences |
Agricultural biotechnology |
Agricultural biotechnology and food biotechnology GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming Agricultural biotechnology related ethics |
Biotechnologie a bionika |
Přístroje výzkumu
| Název přístroje | Technické označení přístroje | Konkrétní využití | Způsoby a možnosti využití podniky (v průmyslu) | Podmínky využití přístroje třetí stranou | Rok výroby | Životnost (počet let) | Přenositelný přístroj |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ELISA reader | Molecular Devices Versa max | Detekce rostlinných virů a mykotoxinů | Ne | ||||
| Laminární boxy typu Biohazard | Steril - Bioban | sterilní práce s tkáňovými kulturami | Ne | ||||
| PCR termocykler | BioRad | molekulární detekce metodou PCR | Ne | ||||
| qPCR temocykler | BioRad | molekulární detekce metodou kvantitativní real-time PCR | Ne |
Možnosti spolupráce
| Možnost spolupráce | Možný rozsah spolupráce | Garantující výzkumný pracovník | Možnosti kontaktování |
|---|---|---|---|
| Detekce rostlinných virů metodou ELISA | dle možností laboratoře | Mgr. Jiří Horáček, Ph.D. | horacek@agritec.cz |
Výzkumný program: Vývoj a aplikace biotechnologických metod ve šlechtění rostlin
- Název výzkumného programu
- Vývoj a aplikace biotechnologických metod ve šlechtění rostlin
- Název výzkumného programu v angličtině
- Vývoj a aplikace biotechnologických metod ve šlechtění rostlin
- Zaměření výzkumného programu
- Vývoj biotechnologických metod a metod genového inženýrství (klasická genetická transformace; NBT – nové šlechtitelské techniky) pro přímé využití ve šlechtitelských programech zemědělských plodin, zejména luskovin (hrách, bob, lupina) a průmyslových plodin (len, konopí, řepka). Tvorba dihaploidů pro zkrácení šlechtitelského procesu, vývoj a optimalizace technik regenerace a mikropropagace, využití planých forem pro mezidruhovou hybridizaci, testování in vitro, agrobakteriální transformace. Zaměření – změny složení obsahových látek semen, zvýšení rezistence vůči rostlinným patogenům, suchovzdornost, fytoremediace toxických těžkých kovů.
- Zaměření výzkumného programu v angličtině
- Development of biotechnological methods and methods of genetic engineering (classical genetic transformation; NBT – New Breeding Techniques) for direct application in the breeding programmes of agricultural crops, namely grain legumes (pea, fababean, lupin) and industrial crops (flax/linseed, hemp, winter rape). Doubled-haploid production for shortening of breeding process, development and optimization of regeneration and micropropagation techniques, utilization of wild forms for interspecific hybridization, in vitro testing, agrobacterial transformation. Objectives–the changes of seed substances composition, improvement of resistance to plant pathogens, drought tolerance, phytoremediation.
- Popis vybraných dosavadních výsledků výzkumného programu
- Protokoly mikropropagace, organogeze a somatické embryogeneze u hrachu, bobu, lnu a konopí. Protokoly tvorby dihaploidů u řepky, lnu a kmínu pro rychlou homozygotizaci a zkrácení šlchtitelského procesu. Protokoly agrobakteriální transformace hrachu a lnu a jejich využití pro tvorbu GM linií hrachu s odolností vůči PSbMV a GM linií lnu se zvýšenou akumulací toxických těžkých kovů pro fytoremediaci kontaminovaných půd. Metodiky genetické transformace bobu a konopí ve stadiu vývoje. Kultury mnohonásobných prýtů, kalusové a suspenzní kultury jsou využívány jako modely pro testování různých substancí in vitro (mykotoxiny, těžké kovy, fytochelatiny, nově syntetizované deriváty růstových regulátorů
- Reference VaV činnosti (výběr)
- Reference řešených výzkumně – vývojových projektů (výběr)
- Webové stránky výzkumu
- www.agritec.cz
- Klíčová slova
-
biotechnologiegenové inženýrstvíluskovinyprůmyslové plodinylenhráchkonopířepkašlechtěnígmotransformaceprašníkové kulturydihaploidyin vitrogenetické zdrojemutacešlechtěníkříženíobrazová analýzaexprese genů
Kategorie
| Hlavní obor | Vedlejší obor | Vedlejší FORD | RIV kategorie |
|---|---|---|---|
|
Agricultural and veterinary sciences |
Agricultural biotechnology |
Agricultural biotechnology and food biotechnology GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming Agricultural biotechnology related ethics |
Biotechnologie a bionika |
Přístroje výzkumu
| Název přístroje | Technické označení přístroje | Konkrétní využití | Způsoby a možnosti využití podniky (v průmyslu) | Podmínky využití přístroje třetí stranou | Rok výroby | Životnost (počet let) | Přenositelný přístroj |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Analyzátor FT-NIRS | FT-NIRS Nicolet Antaris II | Analýza semen luskovin, olejnin, obilovin | 2021 | Ne | |||
| Atomový absorpční spektrometr duální | Thermo Solaar 5 | Stanovení mikroprvků v rostlinném materiálu a v půdě, možnost měření v plameni i v kyvetě | Ne | ||||
| Automatický analyzátor tuků | Gerhardt Soxtherm | Stanovení tuků dle Soxhleta - analýza olejnatých semen | Ne | ||||
| Digitální obrazová analýza | analýza obrazu - software NIS Elements | detekce poškození listů, určení tvaru a barvy listů, květů, kořenů, fenotypizace | Ne | ||||
| ELISA reader | Molecular Devices Versa max | Detekce rostlinných virů a mykotoxinů | Ne | ||||
| Hlubokomrazicí box -70oC | Sanyo | Dlouhodobé uchování vzorků při -70stC | Ne | ||||
| Laminární boxy typu Biohazard | Steril - Bioban | sterilní práce s tkáňovými kulturami | Ne | ||||
| Mikrovlnný rozkladný systém pro AAS | Milestone Ethos D | Příprava vzorků pro AAS - rozklad rostlinných a půdních vzorků | Ne | ||||
| PCR termocykler | BioRad | molekulární detekce metodou PCR | Ne | ||||
| Plynový chromatograf | DANI - GC 1000 | Analýza olejů - stanovení mastných kyselin | Ne | ||||
| Průtokový cytometr | Partec PA II | Určení ploidie | Ne | ||||
| qPCR temocykler | BioRad | molekulární detekce metodou kvantitativní real-time PCR | Ne | ||||
| Zařízení pro Kjeldahlizaci | VELP | Stanovení N-látek dle Kjeldahla | Ne |
Možnosti spolupráce
| Možnost spolupráce | Možný rozsah spolupráce | Garantující výzkumný pracovník | Možnosti kontaktování |
|---|---|---|---|
| Selekce a biotesty in vitro | Založení a vyhodnocení deskových testů s Arabidopsis thaliana a analýza kořenů – odezva na přítomnost testované látky; diskových testů s využitím izolátu fytopatogenních hub ke stanovení účinků testovaných látek; využití in vitro kultur k selekci odolných materiálů vůči abiotickým druhům stresu (těžké kovy, sucho, zasolení atp.) | Ing. Iva Smýkalová, Ph.D. | smykalova@agritec.cz |
| Využití metody analýzy obrazu | Analýza tvarových a barevných charakteristik (30 parametrů) objektů: poškozené listy okusem škůdců nebo houbovými a virovými chorobami; vyhodnocení semen; měření velikosti inhibičních zón u diskových testů; tvorba tvarových kategorií; práce s genetickými zdroji | Ing. Iva Smýkalová, Ph.D. | smykalova@agritec.cz |